納和阿泰之間有愛情，但如果說他們之間的關(guān)系只是愛情，就俗了。他們之間的關(guān)系，是比愛情更深刻的感情。

小納和阿泰生活在同一個小村子里，都是十幾歲的少年。他們都是苦命的孩子，沒什么人疼愛。小納更慘一些，因為性格有點軟弱，又長得白白嫩嫩的，總被同村的孩子叫作同性戀，誰也不跟他玩。阿泰呢，只要他肯跟同村的孩子們一起打鬧并且欺負(fù)小納，大家就會接受他。

小納和阿泰的故事開始于一次放風(fēng)箏。阿泰不知從哪兒弄了個風(fēng)箏，想把它放起來。小納求阿泰帶自己玩，阿泰不答應(yīng)。阿泰一個人折騰了許久也沒能把風(fēng)箏放起來，其他孩子又不在身邊，于是阿泰讓小納幫忙，兩個人一起終于把風(fēng)箏放上了天。

這是兩個人第一次交集。然而，不久其他孩子就懷疑阿泰和小納是朋友，嘲笑他們是同性戀，阿泰為了自保，急忙澄清小納不是自己的朋友。孩子們讓阿泰打小納，阿泰照做了。

后來，小納又求阿泰和自己玩。是的，小納實在是沒有朋友，而阿泰是唯一一個愿意搭理他的孩子。雖然阿泰也會打他，但小納知道，阿泰那是迫不得已。阿泰的本性和其他孩子是不一樣的。這一次，阿泰讓小納去老師的辦公室，把工業(yè)酒精倒進老師的酒瓶里。這個老師不是什么好人，阿泰想報復(fù)他一下。小納很害怕，但為了讓阿泰做自己的朋友，他答應(yīng)了。

可惜，小納被突然返回的老師發(fā)現(xiàn)了。這個老師是個戀童癖，他讓小納把門窗關(guān)上，逼小納給自己口交。被欺負(fù)之前，小納非常恐慌，望向窗外，但找不到阿泰的身影。被欺負(fù)后，小納匆匆地往回走，遇到等著自己的阿泰，頭一次沒有主動和他打招呼。阿泰問小納，要不要和自己一起玩。小納停住腳步，轉(zhuǎn)過頭，露出了開心的笑容。此時小納的心情是苦澀還是開心呢？付出這么大的代價，但對他來說，結(jié)果還是值得的吧。

阿泰和小納開始偷偷摸摸地在一起玩，但還是被其他孩子發(fā)現(xiàn)了。這一次他們做得更過分，他們扒了小納的褲子，用玩具戳小納的屁股。阿泰拒絕和他們一起欺負(fù)小納，但起初并不敢?guī)椭〖{，直到看到這一幕才開始真正地站在小納這邊，和其他孩子打了起來。這是阿泰第一次保護小納。

小納和阿泰有個秘密基地——一個廢棄房屋的屋頂上。在這里可以看見很美的風(fēng)景，而且沒有人打擾。這天，阿泰想喝酒，小納就偷了爸爸的酒給阿泰喝。結(jié)果，當(dāng)天晚上小納因為偷酒被爸爸毒打，阿泰聽到小納的慘叫聲，偷偷地過來查看，打開門后他被眼前的景象驚呆了：小納的爸爸正在強奸小納。震驚過后，阿泰拿了東西打了小納爸爸的頭，拉著小納一起逃了出來。

小納一直哭一直哭。阿泰讓小納躲在一個地方，自己出去把小納的爸爸引開。夜很黑，兩個孩子都很害怕。小納的爸爸拿了把刀，瘋狂地找他們。刀掉落在離小納不遠(yuǎn)的地方，小納突然不哭了，悲痛轉(zhuǎn)為憤怒，他拿起刀，瘋狂地砍向爸爸，把爸爸砍倒在地。阿泰目睹了這一幕，非常害怕，跑開了。小納找到阿泰，渾身顫抖，阿泰知道小納不會傷害自己，不再害怕。天亮后，他們搭車離開了村子。

在城里，他們一起流浪。城里總有小混混欺負(fù)他們。一個戀童癖老外看上了小納，托小混混把小納給他弄來。小混混找上阿泰，說給阿泰一筆錢，讓阿泰把小納交給他。阿泰不答應(yīng)，被揍了一頓。晚上，阿泰躺在地上發(fā)抖。小納不知道如何安慰阿泰，小心翼翼地去抱他。阿泰憤怒地推開小納，罵他是同性戀，然后跑掉了。當(dāng)天晚上，小混混把小納裝進一個紅色的旅行箱，給老外送了過去。阿泰看著手里的錢，反悔了，回去救小納，卻只落得被小混混揍一頓的下場。

從此以后，阿泰和小納再未相見——至少，阿泰是這么以為的。阿泰一直混跡于城市街頭，長大后被腐敗的警察老爹利用，因為殺了一個警察被關(guān)進監(jiān)獄。在監(jiān)獄里，阿泰繼續(xù)被老爹利用，做一個殺手。阿泰有一個女朋友叫小小，小小很癡心，總是來監(jiān)獄看望阿泰，盼望阿泰出獄后和她結(jié)婚。

阿泰總是反復(fù)做同一個夢，夢里有一個碩大的紅色旅行箱。他對監(jiān)獄里的心理醫(yī)生說不知道為什么，自己總是做同一個夢。其實是他忘記了，或者沒有說實話。當(dāng)年把小納裝走的就是一個碩大的紅色旅行箱。這個紅色旅行箱也代表著阿泰的良心。其實，阿泰從未忘記過小納。

不久，城市里發(fā)生了一連串的惡性謀殺事件，受害者尸體無一例外遭到閹割，生殖器被塞進肛門里。有的尸體被切割后裝進紅色旅行箱里拋尸，而政壇大人物的兒子的尸體被倒掛在他自己的廣告牌前。目擊者稱，兇手是一個穿紅色雨衣的人。警察久久不能破案，大人物憤怒，警告老爹，再抓不到兇手，倒霉的就是他了。

兇手的一些做法讓阿泰不由自主地想起了小納，他和老爹達成交易：如果阿泰抓到兇手，老爹想辦法抹去他的犯罪記錄，還阿泰自由。實際上，老爹另有打算，他派手下跟著阿泰，阿泰一抓到兇手就殺掉阿泰滅口。但阿泰并不知情，一心想著抓到兇手，然后和小小一起過正常人的生活。

阿泰回到小時候生活過的村落，看到自己和小納曾經(jīng)生活過的地方，回憶一幕幕閃現(xiàn)。電影故事是從這里開始的，用閃回的方式一幕幕再現(xiàn)阿泰和小納的過往。

當(dāng)阿泰終于追查到小納的下落，知道小納整了容、變了性，并看到小納現(xiàn)在的模樣時，他徹底驚呆了。沒錯，小納就是小小。其實電影播放到這里，許多觀眾應(yīng)該已經(jīng)提前猜到了結(jié)果。但這并不影響電影的好看程度。

阿泰回想起小小和自己相識的過程，想起小小說過的一些話，正是小納曾經(jīng)對他說過的。阿泰還在震驚中沒有緩過神來，老爹的手下已經(jīng)等不及了，用槍指著阿泰，問他是不是已經(jīng)知道了兇手是誰。阿泰這才明白，老爹是要殺掉自己，于是動手殺掉了老爹的手下。

與此同時，另一邊，老爹一直打小小的主意，把小小弄進了警察的安全屋。在安全屋里，老爹露出本來的面目，承認(rèn)自己即將殺掉阿泰，還想占有小小。小小趁機掏出老爹的手槍，打破了老爹的嘴。老爹昏死過去。小小用老爹的手槍，殺掉了安全屋里所有的警察，又把醒過來的老爹也殺了，還閹割了他。

做完這一切之后，小小用老爹的電話打給阿泰。此時無需多言，兩個人都知道對方知道了真相。他們約在他們一起長大的鄉(xiāng)村見面。

在他們小時候的秘密基地，成年的阿泰和已經(jīng)變性的小納再次相見。此時小納的告白是整個故事最核心的地方，也提升了影片的主題。

阿泰問小納一定要做得如果過頭嗎，小納則回應(yīng)阿泰，他所做的一切只是希望阿泰做個好人，小時候那個曾經(jīng)站出來保護弱者的好人。

小納的生命從很久以前就注定了與黑暗相伴，而阿泰是他生命中唯一的光。小納希望，這束光亮永遠(yuǎn)不會失去光芒。他用最極端的手段為自己的命運復(fù)仇，也只能用最極端的方式拯救阿泰。他左右不了最終的結(jié)局，但他別無選擇。

警察來了，小納讓阿泰殺了自己，在小納的一再請求下，阿泰終于照做了。這對小納來說，是他想要的結(jié)局。而阿泰的命運呢，也許并不會好到哪兒去，但至少這一刻，他被拯救了。

小納和阿泰之間也許有愛情，也許沒有，或者只是小納單方面的愛情。但他們彼此的糾葛，早已超出愛情之上。那是生命與生命的拯救與被拯救的關(guān)系。